應以栽培防病為主，輔以藥劑防治。一般可結合防治紋枯病同時進行，栽培防病措施可參照紋枯病，但稈腐病與紋枯病也有所不同，故防治上應注意下述幾點：

（1）在藥劑防治上應把防蟲與控病結合起來進行，徹底防除飛虱和葉蟬，可有效減輕病害。在分蘗至拔節期、孕穗至始穗期和灌漿期視病情蟲情和苗情，分別噴藥各一次，著重噴施植株中下部。藥劑可選用16%噻井懸浮劑（殺蟲劑噻嗪酮與殺菌劑井崗霉素混劑）800~1000倍液，22%雙井水劑（殺蟲雙與井崗霉素混劑）300~400倍液，40%稻瘟凈或異稻瘟凈乳油600~800倍液，50%多菌靈可濕性粉600~1000倍液，或70%托布津可濕性粉1000倍液。

（2）在水分管理上注意防止稻株生育后期田水落干過早、過重，以免促進病情的發展。

（3）為減少菌源，對重病田盡量做到齊泥低割，不留禾頭；病稈盡早燒掉。

（4）選育抗病品種，在廣東，“科白北”田間抗病性表現明顯；“艮丹紅”人工接種表現高度抗病，可作為抗源加以利用。